Вадим, добрый день!
Да, это не только допустимо, но и является стандартной практикой для обращения во «вторую кассацию».
Уточним, что когда вы подаете жалобу в Верховный Суд, вы обжалуете весь массив судебных актов по делу, но акцент можете сделать именно на Постановлении арбитражного суда округа, если считаете, что нарушения были допущены именно там.
Основаниями для отмены или изменения Судебной коллегией Верховного Суда Российской Федерации судебных актов являются: существенные нарушения норм материального права и (или) норм процессуального права, которые повлияли на исход дела и без устранения которых невозможны восстановление и защита нарушенных прав (ст. 291.11. АПК РФ)
Исходя из вышеизложенного, Вы можете обратиться в Верховный суд для обжалования, исходя из Вашей ситуации

Добрый день! Нет подать встречный иск при рассмотрении дела во второй инстанции (при обжаловании) невозможно. Встречный иск предъявляется в суд по месту рассмотрения первоначального иска до вынесения судьей решения по существу. Согласно ч. 7 ст. 268 АПК РФ новые требования, которые не были предметом рассмотрения в арбитражном суде первой инстанции, не принимаются и не рассматриваются арбитражным судом апелляционной инстанции. Встречный иск это как раз новые требования. Но вы можете подать просто иск в суд первой инстанции, если суть спора отличается от той, которую сейчас рассматривает суд.